La Convention nationale est le sommet de l'année du CNEPER. Pendant plusieurs jours, les délégations de toutes les églises, fédérations, confédérations et œuvres membres convergent vers la ville hôte pour célébrer, apprendre et bâtir ensemble.
Au programme : grandes soirées de louange et d'adoration, enseignements apportés par des serviteurs de Dieu du Gabon et d'ailleurs, ateliers thématiques, temps d'intercession pour la Nation et moments de communion fraternelle entre ministères.
